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一、机械消毒法
此方法并非真正杀死微生物，而是通过机械排除。例如，刷洗、冲洗、擦拭、吸附、过滤等。工作人员进入洁净室前的洗手，也属于机械消毒法。由于反复冲洗、擦洗，微生物被机械地排除。有人证明，用8分钟流水冲洗可以除去80%的细菌，15分钟可以除去99.0%。
过滤除菌是利用物理阻留的方法去除微生物。例如，用砂滤法制备生活饮用水，工厂空气净化设施以及戴口罩等，都是利用过滤除菌的有效方法。目前，滤膜孔径最小可达0.01μm，能制取优质的注射用水，可将空气处理到100L中只有1颗0.3μm尘粒的超净水平。
二、热力消毒法
在所有消毒与灭菌方法中，热力是一种应用最早，效果最可靠，使用最广泛的方法。热力杀灭微生物的机理是损伤微生物的细胞壁，细胞膜，破坏微生物的蛋白质（凝固或变性），从而导致其死亡。热力消毒与灭菌的方法分为两类：干热和湿热。
A)干热消毒与灭菌
1.灼烧：灼烧是直接用火焰灭菌。如微生物实验室接种针、接种环、涂菌棒等不怕热的金属器材的灭菌。在没有其他办法灭菌的情况下，对于器材也可以用灼烧法灭菌。灼烧法灭菌温度很高，效果可靠，但对器材有破坏性。
2.干烤：干烤灭菌是在烤箱中进行。适用于高温下不损坏、不变质物品的灭菌。例如，玻璃制品：平板、试管、吸管，注射器等均可用此法灭菌，一般在180℃下，干烤1～2小时。
3.红外线照射：也是干热灭菌的一种方法。其波长是0.77～1000μm的电磁波，有良好的热效应，尤其是在1～10μm波长段。红外线的热能直接由放射的电磁波产生，不需要经空气传导，加热速度快。但热效应只能在照到的表面产生，不能使一个物体的左右前后均匀加热。高强度远红外线可以产生200℃高温，因此可以用于医疗器械的灭菌，20世纪60年代前曾受到重视，但由于后来塑料高分子产品增多，使这种灭菌方法未能广泛使用。
(B)湿热消毒与灭菌
1.煮沸法：煮沸法消毒是使用最早的消毒方法之一。由于其方法简单、方便、经济、实用效果好，因此今仍是一种常用的消毒方法。煮沸消毒的能力较强，一般在水沸腾后再煮5～15分钟，即可达到消毒目的。100℃几乎能立即杀灭细菌繁殖体、真菌、立克次氏体、螺旋体和病毒等。芽胞型菌则抗煮沸能力较强，一般要1小时以上，甚至高达8小时之多。如果能在煮沸时加入增效剂，可以增强煮沸消毒效果，如在煮沸针尖时，加入1～2%碳酸钠，煮沸5分钟即可达到灭菌要求，同时还要防止其生锈，保持它的锋利。零配件(如瓶塞穿孔器、接头、护套)的清洗处理中，加0.5%盐酸或氢氧化钠液煮沸也能起到增效的作用。
2.高压蒸汽灭菌：目前常用下排气式高压灭菌器，使用方法等介绍如下：
手提式高压灭菌器：是实验室、卫生医疗单位常用的小型灭菌器空拦。由铝合金材料制造，为单层圆筒，内有一铝质的盛物捅，直径28cm，深28cm，容积约181，全重18kg，使用压力<1.4kg/cm2。主要部件有：压力表1个，指示高压锅内压力。排气阀1个，下接排气软管，伸至盛物桶下部，用以排除冷空气。安全阀1个，当高压锅内压力超过1.4kg/cm2时，可以自动开启排气。使用方法：在高压锅内放入约4cm深的清水，将消毒物品放入盛物桶内，装物不宜太多，且应使物品间留有空隙，盖上锅盖，注意将排气软管插入盛物桶壁上的方管内，拧紧螺丝。当加热到表压为5～10磅/英寸2时，打开排气阀，放冷空气，至有蒸气排出，即关闭排气阀，待上升至所需压力，调节热源，维持到预定时间。结束后排气至0，打开盖子，取出物品。消毒液体时，最好慢慢冷却，以免减压过快液体外溢或瓶破裂。（1）必须将灭菌器内冷空气抽尽或排尽，空气的排尽程度与温度的关系极为密切（2）合理计算时间。其时间的计算，应从灭菌器内达到温度要求时算起，至完成灭菌为止。一般下排气式高压灭菌器为121℃15分钟或115℃30分钟。（3）包装与容器不宜过大，过紧，也不宜将物品放于铝饭盒内。（4）合理布放物品。不宜过多，一般为85%，且物品间留有空隙。（5）注意安全操作，每次灭菌前应检查灭菌器是否处于良好的工作状态，尤其是安全阀是否良好，盖是否关紧。加热宜均匀，灭菌后减压不可过猛。压力表退回“O”处才可打开盖。6）为监测灭菌效果，可采用留点温度计或嗜热脂肪芽胞菌生物指示菌片。
三、紫外线消毒杀菌原理与作用
紫外线可分为长波段、中波段和短波段3组。以短波段250．0～265．0nm的杀菌力最强。一般多以253．7nm作为紫外线杀菌波长的代表。紫外线照射能量较低，不足以引起原子的电离，仅产生激发作用，使电子处于高能状态而不脱开。当微生物被照射，此作用可引起细胞内成分，特别是核酸、原浆蛋白与酶的化学变化，从而使之死亡。
各种微生物对紫外线的耐受力不同，真菌孢子对紫外线的耐受力最强，芽胞菌次之，细菌繁殖体最差。但也有例外，如橙黄八叠球菌的耐受力反比枯草杆菌芽胞高。因紫外线是一种低能量的电磁辐射，故穿透力极差，空气中的湿度、尘粒对其均有影响；在液体中，亦随深度增加而降低。各种杂质(盐、有机物等)均可影响紫外线作用，它不能透过固体物质。普通玻璃中有氧化铁，可阻挡紫外线。因此，它无法透过2mm厚的窗玻璃。但能透过石英，糊窗纸可透过20～40％；聚氯乙烯薄膜，开始时可透过30%，但6h后，由于薄脱变质，透过率可以降至3％以下。
四、微波灭菌法
微波是指频率在30~3000MHz之间的电磁波。水可强烈地吸收微波，使其极性分子转动，分子间的磨擦而生热，且升温迅速，靠热力而灭菌。在数十秒至几分钟之内可达100～150℃，并全部杀死液体中的微生物，适于水溶性注射液的灭菌。另外，固体药材饮片及固体制剂（丸剂、散剂、胶囊粉等）也含少量水分，微波能穿透到固体内部，由表至里被均匀加热，而起干燥、灭菌的作用。多用于口服液体制剂的灭菌，有望用于注射液的灭菌。但可能对某些药品的PH值、含量、颜色有影响。
五、电消毒法
臭氧是以无声放电法产生的。在一对交流电极之间隔以介电体，当空气或氧气通过高压电极(6000～8000V)时，在具有足够动能的放电电子中，使氧分子电离，一部分氧分子被聚合为臭氧。臭氧有很强的杀菌力，高效、广谱。有的医用高分予器材厂采用臭氧发生器进行了净化车间的空气消毒，效果甚为满意。
六、辐射消毒法
(一)概况
高压灭菌器技术参数介绍如下：基本型高压灭菌器型号为CL-32L，具备暖空气干燥功能的型号为CL-32LDP。
灭菌舱尺寸为φ320×676mm，容量为54L，最高温度可达140℃，最大压力为0.27MPa（2.7kg/cm3）。温度范围覆盖灭菌40-140℃、融化40-99℃、保温40-60℃，操作时间灵活调整为灭菌、融化：0分钟-10小时或连续；保温：0分钟-48小时。
控制器采用微处理机控制，图形显示，具备多种操作模式：A模式为加热→灭菌→排气（可调）；B模式为加热→灭菌→排气（可调）→保温；C模式为融化→保温。空气排出装置通过温度传感器、时间控制及电磁阀实现定时排空气系统。
带干燥的操作模式分为D模式加热→灭菌→排水→干燥；E模式为只干燥。干燥装置采用用电热器和空气泵（真空泵）使热空气通过，0.2μm的微孔过滤器后循环排放，干燥温度范围为60-180℃，定时范围为0分钟-99小时或连续。
安全装置包括双内锁系统、舱盖关闭检查系统、过压检测、超温检测、漏水保护、传感器断路指示、不正常时间指示、断电记忆、安全阀、轻微漏电、过流与短路断路器等。
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