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人体在呼吸系统局部的防御功能减退，以及全身的免疫功能减退的情况下，遇到外界的致病因素，就可能会导致呼吸道感染的发生。常见的病因，如微生物的因素，有病毒，细菌，还有些非典型的病原体，常见的病毒，如腺病毒，流感病毒，冠状病毒，单纯疱疹病毒，呼吸道合胞病毒等，细菌常为流感嗜血杆菌，肺炎链球菌，卡他莫拉菌，还有些衣原体和支原体，军团菌的感染，都会引起呼吸道的炎症的发生。
本书从临床视角出发，深入探讨呼吸系统感染的各个方面，依据科学依据解析感染的治疗策略。首先，基础科学章节帮助读者理解常见感染，接着是针对感染性肺部疾病的临床处理方法。区别于常规，本书聚焦于特殊高危人群的感染治疗，强调临床表现和流行病学资料的重要性。
随着研究的进展，呼吸系统感染的复杂性引发了诊断、治疗和预防技术的革新。分子生物学和新药物的出现为肺部感染治疗提供了有力工具，疫苗研发也取得积极进展。本书内容丰富，包括6个部分，45个章节，详尽讨论了防御机制、宿主反应、特殊人群感染、病原体、诊断方法、抗微生物治疗和预防策略等。
第一部分详述了肺部防御机制、非特异性防御、免疫反应和抗生素耐药等内容。第二部分深入探讨特殊人群感染的临床处理。第三部分列举了各类病原体，既有常见病原体，也包括新发现的。第四部分聚焦微生物学诊断和侵袭性检查技术。第五部分详细阐述了抗微生物药物的作用。第六部分着重于预防治疗，包括疫苗疗法的探讨。
呼吸系统感染性疾病是由细菌、病毒、支原体、真菌和寄生虫等多种微生物引起的感染性疾病，是临床常见病和多发病，病情严重程度因致病原、感染部位、被感染人群以及合并基础疾病的情况不同而表现各异。《成人呼吸系统感染性疾病病原学诊断专家意见》旨在规范标本的采集、储存、运输、检测过程，提高对感染性呼吸道标本检测效率和准确率，同时对各种检验方法的结果判读进行归纳总结，为临床治疗方案的选择提供帮助。
呼吸道病原学检测标本的采集方法
呼吸道病原学标本的采集方法见表1。
表1呼吸道病原学标本类型及采集方法
标本的运送、储存和预处理
1.标本的运送和储存原则
首先标签应准确，信息完整，贴在容器上，而不是容器盖上。不同病原体检测标本的采集和转运原则见表2。
表2不同病原体检测标本的采集、收集和转运原则
不同类型标本采集量、保存和转运时间见表3。
表3不同时间标本的采集量、保存和转运时间
2.针对不同病原体的检测方法
标本采集后应及时进行质量控制，合格的标本应尽可能短期内送检。某些特殊病原体标本的转运、保存和检测方法见表4。
表4特殊病原体标本的转运、保存条件及检测方法
呼吸道病原体检测方法的优缺点
不同检验方法的优缺点见表5。
表5病原体不同检测方法的优缺点
注：PCR：聚合酶链式反应；RT‐PCR：实时逆转录PCR；mPCR：多重PCR；qPCR：实时荧光定量PCR；LAMP：环引物介导的等温扩增；NASBA：核酸序列扩增；RPA：重组聚合酶扩增；SDA：链置换扩增；POCT：即时检验或床旁检测；ITS：内部转录间隔区；NGS：二代测序技术病原检测结果的判读及其临床价值
病原学检查结果的判读应该综合考虑患者的年龄、基础疾病、免疫状态、临床特点、病情严重程度以及先期的抗感染治疗等情况。
1.直接抗原快速检测
胶体金法病毒抗原快速检测方法简便、快速、成本低。病毒抗原快速检测的特异性较好，但存在敏感度低、假阴性率较高的问题。当临床高度怀疑为病毒感染，但病毒快速检测结果为阴性时，应加做病毒核酸检测，以排查假阴性。
2.血清特异性抗体检测
适合在门诊、急诊或基层医院用于病原体的筛查。但由于早期阳性率较低，需要采集急性期及恢复期双份血清进行检测和效果评价，但体液免疫缺陷的患者可呈假阴性。
3.涂片
所获取的各种标本均应行病原学涂片检查。在结果判读时，需要结合患者的临床症状和影像学表现，排除操作过程或环境污染的可能。BALF离心沉淀后行六胺银染色、抗酸染色和革兰染色可分别用来检测肺孢子菌、分枝杆菌和部分细菌等。肺穿刺标本和胸腔积液涂片发现病原体对确诊具有重要意义。
4.培养
在进行痰培养前必须确定是合格痰标本，并排除操作不当或环境污染的情况。定量培养有助于区分致病菌和定植菌。
5.核酸分子扩增检测和基因芯片检测
核酸分子扩增及等温扩增基因芯片检测等方法可实现快速分子诊断，所需时间短，但现有核酸分子扩增技术也存在一定的局限性，尤其是难以快速检测和确定多药耐药病原菌的耐药基因突变部分。
以上内容摘自：中国研究型医院学会呼吸病学专业委员会成人呼吸系统感染性疾病病原学诊断专家意见编写组，成人呼吸系统感染性疾病病原学诊断专家意见，中华结核和呼吸杂志.2020.43(9):757-764.电话+V： 159999-78052
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