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由于环氧乙烷易燃、易爆，且对人有毒，所以必须在密闭的环氧乙烷灭菌器内进行。
环氧乙烷灭菌器及其应用：
1.目前使用的河南三强环氧乙烷灭菌器种类很多，大型的容器有数十立方米，中等的有1～10立方米，小型的有零点几至1立方米。它们各有不同的用途。
2.大型环氧乙烷灭菌器：一般用于大量处理物品的灭菌，用药量为0.8kg/m～1.2kg/m，在55℃～60℃下作用6h。
3.中型环氧乙烷灭菌器：一般用于一次性使用诊疗用品的灭菌。这种灭菌设备完善，自动化程度高，可用纯环氧乙烷或环氧乙烷和二氧化碳混合气体。一般要求灭菌条件为：浓度，800mg/L～1000mg/L，温度，55℃～60℃，相对湿度60%～80%，作用时间6h。灭菌完成需抽真空。灭菌物品常用可透过环氧乙烷的塑料薄膜密闭包装。如果在小包装上带有可过滤空气的滤膜，则灭菌效果更好。
4.小型环氧乙烷灭菌器，多用于医疗卫生部门处理少量医疗器械和用品，目前有100%纯环氧乙烷或环氧乙烷和二氧化碳混合气体。这类灭菌器自动化程度比较高，可自动抽真空，自动加药，自动调节温度和相对湿度，可自动控制灭菌时间。
环氧乙烷灭菌器是使用环氧乙烷气体做灭菌剂的一种装置。可在常温下杀灭各种微生物，包括芽孢、结核杆菌、细菌、病毒、真菌等。
环氧乙烷灭菌器主要分为3类：
大型环氧乙烷灭菌器:一般用于大量处理物品的灭菌，用药量为0.8kg/m~1.2kg/m，在55℃~60℃下作用6h。
中型环氧乙烷灭菌器:一般用于一次性使用诊疗用品的灭菌。优点：设备完善，自动化程度高，可用纯环氧乙烷或环氧乙烷和二氧化碳混合气体。一般要求灭菌条件为:浓度800mg/L~1000mg/L，温度55℃~60℃，相对湿度60%~80%，作用时间6h。灭菌完成需抽真空，灭菌物品常用可透过环氧乙烷的塑料薄膜密闭包装。
小型环氧乙烷灭菌器：多用于医疗卫生部门处理少量医疗器械和用品，目前有100%纯环氧乙烷或环氧乙烷和二氧化碳混合气体。可自动抽真空，自动加药，自动调节温度和相对湿度，可自动控制灭菌时间。
灭菌环境要求：
需灭菌的物品必须彻底清洗干净，不能用生理盐水清洗，灭菌物品上不能有水滴，以免造成环氧乙烷稀释和水解。环氧乙烷几乎可用于所有医疗用品的灭菌，但不适用于食品、液体、油脂类、滑石粉和动物饲料等的灭菌。纸、复合透析纸、布、无纺布、通气型硬质容器、聚乙烯等包装材料都可以用环氧乙烷灭菌;金属箔、聚氯乙烯、玻璃纸、尼龙、聚酯、聚偏二氯乙烯、不能通透的聚丙烯不能用环氧乙烷灭菌。
使用特点：
1.在一定范围内，温度升高、浓度增加，可使灭菌时间缩短。在使用环氧乙烷灭菌时必须合理选择温度、浓度和时间参数。
2.控制灭菌环境的相对湿度和物品的含水量: 细菌本身含水量和灭菌物品含水量，对环氧乙烷的灭菌效果均有显著影响。一般情况下，以相对湿度在60%~80%为最好。含水量太少，影响环氧乙烷的渗透和环氧乙烷的烷基化作用，降低其杀菌能力;含水量太多，环氧乙烷被稀释和水解，也影响灭菌效果。为了达到理想的湿度水平，第一步是灭菌物必须先预湿，一般要求灭菌物放在50%相对湿度的环境条件下至少2h以上;第二步可用加湿装置保证柜室内理想的湿度水平。
3.注意菌体外保护物对灭菌效果的影响:菌体表面含有的有机物越多，越难杀灭;有机物不仅可影响环氧乙烷的穿透，而且可消耗部分环氧乙烷。在无机盐或有机物晶体中的微生物，用环氧乙烷难以杀灭。因此进行环氧乙烷灭菌前，必须将物品上有机和无机污物充分清洗干净，以保证灭菌成功。
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