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商铺的房产证办理需要交纳的税费如下：
1、契税：房款的1.5%（面积在144平米以上的需要缴纳3%，面积在90平米以下并且是首套房的可以缴纳1%）。
2、印花税：印花税分为“产权转移书据”印花税和“权利许可证照”印花税。“产权转移书据”税目税率为万分之五，计税依据为书据中所载的金额，买卖双方均要交纳。“权利许可证照”税目适用5元／件的定额税率，买方交纳。
3、维修基金：购买不配备电梯房屋的购房人按75元/平方米（按房屋建筑面积计）交存。购买配备电梯房屋的购房人按120元/平方米（按房屋建筑面积计）交存。
4、交易费：3元/平方米。
5、测绘费：按各区具体规定。
6、权属登记费及取证费：按各区具体规定，一般情况是在200元内。
商铺房产税每年都要交。
目前只有部分城市实施征收房产税。房产税是以房屋为征税对象，按房屋的计税余值或租金收入为计税依据，向房屋产权所有人征收的一种财产税。
购买商铺需要缴纳税如下：
1、购买商场商铺要交国税的税，企业所得税，地税的印花税。国税附加税。代扣代缴个人所得税；
2、满五5年，需缴纳交易过户费：5元／平方米；营业税及其他附加费：总额的5.6％；个人所得税，差额20％；土地税，3％；契税为成交价的4％；
3、在商铺税收方面，买入较简单，主要是买入合同金额的3％契税和0.05％的合同印花税；
4、卖出的税收计算比较复杂。买卖合同差价的5.65。65％营业税及附加土地税。按照买卖差价与原买入价计算得到利润率，分为不同的档次计算：小于等于50％，税率为30％；大于50％小于等于100％，税率为40％；大于100％小于等于200％，税率为50％；大于200％，税率60％。在扣除了营业税和土地税后，剩余的净利润再按照20％征收所得税；
5、一般业内估计商业地产卖出税收时，以买卖差价的40％左右计算。关于包租，法律上是不允许开发商直接包租的，但目前大多是由商场运营企业（有些是由开发商另外注册的经营管理公司）与业主签订长期租赁合同，这是合法的。长租赁期限不超过20年。
综上所述，商业用房是要交房产税的。根据规定，房产税需要依照房产原值一次减除10%至30%后的余值计算缴纳。具体减除幅度，由省、自治区、直辖市人民政府规定。没有房产原值作为依据的，由房产所在地税务机关参考同类房产核定。房产出租的，以房产租金收入为房产税的计税依据。
【法律依据】：
《中华人民共和国房产税暂行条例》第七条
“房产税按年征收、分期缴纳。”因而，房产税是需要每年缴纳的。但纳税期限由省、自治区、直辖市人民政府规定，就有各城市、地区的征税时间并不一致的说法。但是房产税每年都要加这个规定却是统一的！
会计人员在处理会计税务内容的时候需要了解商铺税费的相关知识内容，以及商铺税费的相关内容计算，因此为了大家能够更加全面的了解会计税务的内容，小编今天就为大家整理了一些关于商铺税费计算的知识内容。
购买方税费：
契税:合同价×3%
印花税：合同价×0.05%
手续费：合同价×0.5%
有贷款则缴纳登记费：500元。
卖家出售的时候交纳以下几种税费：
房地产交易手续费:每平方米3元。
印花税：房屋产价0.05%。
土地增值税：
A、有购房发票，[转让收入-上手发票价(每年加计5%)-有关税金]×适用税率。
B、没有购房发票，(转让收入-转让收入×90%)×30%。
个人所得税：
据实征收：(转让收入-房产原值-合理费用)×20%
核定征收：转让收入×7.5%×20%。
转让收入-房产原值-合理费用=个人净收入。
营业税及附加税：
A、有购房发票，(转让收入-上手发票价)×5.5%。
B、没有上手发票，转让收入×5.5%。
C、税费为差额的5.56%
土地出让金：
商业用途用房，网格点基准地价35%;
商业路线价区段路的商业临街宗地，加收路线价10%;
办公用途用房，网格点基准地价30%。
土地出让金契税：
土地出让金价款3%
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