rna的沉降系数组成是什么类型

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一、通过保守序列测序来鉴定微生物，可靠性有多少

二代测序在微生物研究中使用的频率越来越高了，通过16SrDNA测序可以得到微生物基因组的序列信息，通过序列比对即可鉴定出微生物的种属，从而进行后续的分析。今天我们就来聊一聊16SrDNA测序是如何鉴定微生物到种的！

1.什么是16SrDNA？

细菌rRNA（核糖体RNA）按沉降系数分为3种，分别为5S、16S和23SrRNA。16SrRNA为核糖体的RNA的一个亚基，16SrDNA就是编码该亚基的基因。16SrDNA因其序列在物种间的高度多样性，成为细菌分类学研究的“分子钟”，素有“细菌化石”之称。16SrDNA基因全长1542bp，由9个可变区和10个保守区组成。其中保守区反映了生物物种间的亲缘关系，而可变区则表明物种间的差异，且变异程度与细菌的系统发育密切相关。

图16SrDNA基因组成（灰色为保守区，绿色为可变区）

2.什么是16SrDNA测序？

在细菌基因组中，编码16SrRNA的rDNA基因具有良好的进化保守性，适宜分析的长度（约为1.5kb），以及与进化距离相匹配的良好变异性，所以成为细菌分子鉴定的标准标识序列。16SrDNA测序即是对16SrDNA特定可变区（可选择单可变区或是多可变区）进行PCR扩增，再结合高通量测序和生物信息分析，帮助研究人员进行大规模鉴定群落组成，表达丰度，以及开展系统进化分析的方案。该方案因其无需分离培养细菌，实验操作简单，并可大规模鉴定特定生境中全部菌群而成为研究微生物群落多样性的首选方案。

3.16SrDNA测序如何鉴定微生物到种？

联川基于最新版Greengene和自建数据库以及V3、V4双可变区扩增测序，并配合自主开发的数据分析程序可以将菌群鉴定到分类学上“种”的级别（目前最多可鉴定4414个种，覆盖2106个属，可鉴定菌种持续更新中......）。

(图片仅供参考)

4.微生物鉴定到种的意义？

在医学研究中，将菌群鉴定到种的级别具有重要的临床应用价值，因为这不仅可以鉴定出某种传染病的关键致病菌种，还可以帮助临床医生选择适合的抗生素，以及确定治疗持续的时间和制定传染控制程序。

二、RNA的5S、5.8S、18S和28S中的S是什么意思啊

生物体内一般含有核糖体RNA（rRNA）、信使RNA（mRNA）、转运RNA(tRNA)三种主要的RNA，其中rRNA含量最多，提取组织总RNA所得最多的就是rRNA。真核生物中含有5S、5.8S、18S、28S，原核生物中有5S、16S、23S；而植物组织中一般较多的为5S、18S、28S

RNA的分类有哪些？简单聊聊信使RNA和转移RNA

人体一个细胞含RNA约10pg，而含DNA约7pg。与DNA相比，RNA种类繁多，分子量较小，含量变化大。RNA可根据结构和功能的不同分为信使RNA和非编码RNA。非编码RNA分为非编码大RNA和非编码小RNA。

非编码大RNA包括核糖体RNA、长链非编码RNA，简称lncRNA，长约300～1000nt。非编码小RNA包括转移RNA、核酶、小分子RNA等。小分子RNA长约20～300nt，包括miRNA、siRNA、piRNA、scRNA、snRNA、snoRNA等，细菌也有小分子RNA，长约50～500nt。

接下来咱们先简单说说信使RNA和转移RNA。

信使RNA，即mRNA，最早发现于1960年，在蛋白质合成过程中负责传递遗传信息、直接指导蛋白质合成，具有以下特点。

1.含量低，约占细胞总RNA的1%～5%。

2.种类多，可达105种。不同基因表达不同的mRNA。

3.寿命短，不同mRNA指导合成不同的蛋白质，完成使命后即被降解。细菌mRNA的平均半衰期约为1.5分钟。脊椎动物mRNA的半衰期差异极大，不过平均约为3小时。

4.长度差异大，哺乳动物mRNA长度为5×102～1×105nt。

原核生物与真核生物的mRNA虽然在结构上有差异，但功能一样，都是指导蛋白质合成的模板。

而转移RNA，即tRNA，则在蛋白质合成过程中负责转运氨基酸、解读mRNA遗传密码。tRNA占细胞总RNA的10%～15%，绝大多数位于细胞质中。tRNA由Crick于1955年提出其存在，Zamecnik和Hoagland于1957年鉴定出来。

tRNA一级结构具有以下特点：①是一类单链小分子RNA，长73～95nt，其中共有序列76nt，沉降系数为4S。②是含稀有碱基最多的RNA，含7～15个稀有碱基，约占全部碱基的15%～20%，位于非配对区。③5′末端碱基往往是鸟嘌呤。④3′端是CCA序列，其中的腺苷酸常称为A76，其3′-羟基是氨基酸结合位点。

而tRNA二级结构则约有50%碱基配对，形成四段双螺旋，与五段非配对序列形成三叶草形结构。该结构中存在四臂四环：①氨基酸臂。②二氢尿嘧啶臂，即DHU臂和二氢尿嘧啶环，即DHU，特征是含二氢尿嘧啶DHU。③反密码子臂和反密码子环，特征是反密码子环含反密码子。反密码子5′端与尿苷酸连接，3′端与嘌呤核苷酸连接。④TΨC臂和TΨC环，特征是TΨC环含胸腺嘧啶核糖核苷酸T54-假尿苷酸Ψ55-胞苷酸C56。④额外环，其约为3～21nt。

tRNA的三级结构呈L形，氨基酸结合位点位于其一端，反密码子环位于其另一端，DHU环和TΨC环虽然在二级结构中位于两侧，但在三级结构中却是相邻的。

尽管各种tRNA的长度和序列不尽相同，但其三级结构相似，提示三级结构与其功能密切相关。

今天先说到这，下次咱们来说说核糖体RNA。

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